进行公共部门绩效评估面临的困难：
（1）公共部门的产出难以量化。
①“非商品性产出”，对其数量上的正确测量带来技术上的困难。
②无法取得可比较的成本或收益数据（无竞争单位）。
③即使可量化，以量化形式表现绩效不适宜。
（2）目标缺乏准确性。
①绝大多数体制中存在多重的甚至相互冲突的目标。
②目标常具有抽象性和笼性。
③目标过大过高难以达到，评估的实际操作困难。
（3）绩效标准指标难确定。
①与品质有关的指标难以制定。
②功能相同的公共组织地区性、规模、大小均有差异性，以同样指标衡量，有失公平。
③主观判断的片面性。
（4）评估信息系统的不健全。
①信息收集困难。
②信息沟通障碍。
（5）管理者与评估者的对立。