子商务企业建网站直接销售模式，尽管具有商品种类多的优势，但是却具有难以克服的致命缺点，主要表现在：货源组织困难；商品信息的采集、分类整理、网络上传等均需投入巨大的人力、物力；对单一产品的采购数量有限，商品的采购价格高；配送问题难以解决，若自建物流配送体系，不仅耗费时间长（例如当当网花费了7年时间），而且投资巨大，中小型企业难以承担。若依托邮政和第三方物流企业则不能有效监测物流配送过程，难以控制物流服务质量及直接获得顾客的意见和建议，企业在整个业务流程中处于被动地位。
虽然目前电子商务在我国已开始形成热潮，但积极参与的还只是一些信息技术公司。从整个社会来看，有两方面准备的还不足：一方面是基础工作，即企业信息化程度不高。无论是工业企业、商业企业还是外贸企业，它们本身使用计算机进行业务处理与信息管理，或是开展网上业务，都没有达到应有的规模。企业信息化是开展电子商务的基础，企业没有实现经营业务处理的数字化，就不能上网，就不能实行电子商务。
　　另一方面，政府的工作准备还不够。电子商务不同于传统商务，是一种以网络为载体的新的商务运作模式。开展这项工作，就会涉及到有关的法规和标准问题，比如数字签名、电子合同等，是否能够得到法律的认可，目前在这些方面还没有相应的法规出台。但“电子商务年”促使国务院法制局、北京市法制办密切关注这个问题，大家都在探讨如何制定电子商务所涉及的法律问题。当前在法律尚不完善的情况下，遇到问题可由仲裁委员会解决争端。